本會是由出生屏東縣牡丹鄉，排灣族籍的董森醫師，在20多年前所發起的，籌備時間約10 年，終於在2003 年於台北醫學大學正式成立。創會會員人數64人，第一屆共推選出26位理監事，理事長由高學醫學大學葛應欽教授（漢族）擔任（2003-2004），第二屆理事長由林慶豐博士（阿美族）擔任（2005），現任行政院衛生福利部醫管會執行長，後由台北醫學大學鍾文政教授（漢族）接任（2006），第三任由台東縣金峰鄉衛生所主任高正治醫師（排灣族）接任（2007），第四和五任理事長由國立台北科技大學分子系華國媛副教授（排灣族）擔任（2010-2014） ，第七屆和第八屆理事長由屏東縣霧台鄉衛生所主任康孝明醫師(魯凱族)擔任(2015~2019)，第九屆理事長由桃園市復興區衛生所主任林德文醫師(泰雅族)擔任(2019年10月至2021年12月)，現任第十屆理事長仍由桃園市復興區衛生所主任林德文醫師(泰雅族)擔任(2022年1月底至2023年12月)。
